研究项目1
项目名称: 数据驱动的癌症健康差异生物学基础的泛癌症研究
PI: 张坤博士.D.
总体目标/目标:
的 目标 因此，这个RCMI研究项目的目的是通过进行深入的研究来解决这些重大的限制, 数据驱动的, 泛癌症研究研究癌症特异性突变组, 表观基因组, 不同种族群体的RNA-Seq转录组差异. 拟议的研究将集中在八种TCGA癌症类型上, 与其他来源的相关癌症数据(E.g. dbGaP、GEO、ICGC等.)在整个项目中系统地用于方法开发和/或经验验证. 对于某种特定的癌症, 与临床数据相关, 我们将开发新的生物信息学算法和管道来单独和集体地分析这些多种类型的组学数据. 像这样, 我们将建立一个泛癌症, 单级和多级相干基因的种族相关组合, 模块和生物途径, 其中一些将具有临床应用的意义和前景. 这将为癌症中种族差异的生物学机制提供大规模的直接分子水平证据, 这在体外几乎是不可能的, 体内和/或群体随访. 此外, 我们将使用临床样本对已识别的前列腺癌特征进行生物学验证. 将建立一个包含所有精确标记的数据库，以便癌症差异研究人员可以研究不同水平的分子变异如何改变不同癌症和种族的基因功能. 还将作为开源软件向公众提供一套有效而强大的分析工具，用于拟议的数据驱动的癌症健康差异分析.
研究学科: 基本的生物医学